Det engelsksprogede enkeltfag Mass spectrometry in protein chemistry and proteomics er et naturvidenskabeligt fag, som henvender sig til forskere.
Faget består af følgende:
- Overblik over analytiske strategier i proteinkemi og proteomisk forskning baseret på massespektrometri.
- Overblik over proteinmodifikationer og behandling
- Introduktion til MALDI- og ESI-massespektrometri samt forskellige masseanalysatorer.
- Berigelse af proteiner og peptider, der bærer post-translationelle modifikationer som f.eks. fosforylerede peptider
- Prøvefremstillingsmetoder for MS, herunder brugen af specialfremstillede kromatografiske kolonner med omvendt fase, grafit og IMAC samt TiO2-resiner.
- Bestemmelse af post-translationelle modifikationer ved hjælp af massespektrometri
- Betydningen af høj massenøjagtighed i analyse af post-translationelle modifikationer
- Forskellige strategier for kvantifikation af peptider som f.eks. SILAC, iTRAQ og labelfrit samt følgende strategier for dataanalyse
- Indsamling af oplysninger fra MS/MS-spektre. Elektronisk dataanalyse og protein-sekvensanalyse.
Undervisningen er tilrettelagt som mundtlige præsentationer (14 timer), laboratorieøvelser/praktiske øvelser (18 timer) og elektronisk dataanalyse (8 timer). Al undervisning foregår på engelsk.
Faget kan udbydes Syddansk Universitet i Odense.
Evaluering
Bestået/ikke bestået. Intern eksaminator.