Du får kendskab til brugen af bioinformatik, datafortolkning og resultatvalidering med hensyn til massespektrometriske analyser af protein og peptider inden for proteomik. Du introduceres til forskellige bioinformatiske værktøjer, der er nyttige til fortolkningen af oplysninger fra massespektre.
Kurset giver dig en kort introduktion til analytiske strategier baseret på moderne massespektrometri, herunder forskellige typer af ioniseringsteknikker og masseanalysatorer.
Bestemmelse af strukturen i peptider/proteiner ved hjælp af massespektrometri og tandem-massespektrometri.
Overblik over bioinformatiske værktøjer til proteomik, primært til identifikation og karakterisering gennem massespektrometridata og yderligere analyse af opnåede resultater.
Søgeparametre og validering af søgeresultater introduceres og diskuteres.
Desuden beskæftiger kurset sig med emner som kalibrering af spektre, brug af databaser til søgning, fejltolerante søgninger og sekventering af modificerede peptider ved hjælp af massespektrometri.
Undervisningsformen kan variere. Se holdinformationen.
Uddannelsen kan udbydes Syddansk Universitet i Odense.
Evaluering
Aktiv deltagelse i øvelser er obligatorisk.